Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLIRPQ9GZT3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms