Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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