Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ROPN1BQ9BZX4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms