Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5DQ9BY66 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms