Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF17Q9BXT8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms