Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms