Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USB1Q9BQ65 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms