Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms