Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRSK1Q8TDC3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms