Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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