Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms