Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms