Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms