Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC117Q8IWD4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms