Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUFY3Q7L099 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms