Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C10orf55Q5SWW7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms