Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms