Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms