Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms