Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms