Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPP1Q16831 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms