Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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PDK4Q16654 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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PDK4Q16654 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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PDK4Q16654 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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