Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms