Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXNQ16595 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXNQ16595 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXNQ16595 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXNQ16595 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FXNQ16595 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXNQ16595 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXNQ16595 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXNQ16595 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXNQ16595 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXNQ16595 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXNQ16595 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXNQ16595 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXNQ16595 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXNQ16595 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXNQ16595 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXNQ16595 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXNQ16595 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXNQ16595 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXNQ16595 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FXNQ16595 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXNQ16595 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXNQ16595 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXNQ16595 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXNQ16595 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXNQ16595 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXNQ16595 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FXNQ16595 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXNQ16595 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXNQ16595 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXNQ16595 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXNQ16595 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXNQ16595 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXNQ16595 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXNQ16595 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXNQ16595 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXNQ16595 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXNQ16595 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXNQ16595 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXNQ16595 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXNQ16595 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXNQ16595 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXNQ16595 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FXNQ16595 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FXNQ16595 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FXNQ16595 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FXNQ16595 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FXNQ16595 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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