Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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