Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms