Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SSX1Q16384 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SSX1Q16384 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SSX1Q16384 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SSX1Q16384 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SSX1Q16384 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SSX1Q16384 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SSX1Q16384 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SSX1Q16384 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SSX1Q16384 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX1Q16384 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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