Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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