Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms