Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SF1Q15637 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SF1Q15637 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SF1Q15637 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SF1Q15637 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SF1Q15637 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SF1Q15637 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SF1Q15637 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
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