Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms