Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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