Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
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