Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCAPHQ15003 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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