Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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