Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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COL4A6Q14031 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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COL4A6Q14031 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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COL4A6Q14031 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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COL4A6Q14031 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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COL4A6Q14031 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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COL4A6Q14031 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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COL4A6Q14031 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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COL4A6Q14031 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL4A6Q14031 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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