Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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