Protein–RNA interactions for Protein: Q13686

ALKBH1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH1Q13686 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALKBH1Q13686 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms