Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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