Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms