Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TROQ12816 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TROQ12816 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TROQ12816 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TROQ12816 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TROQ12816 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TROQ12816 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TROQ12816 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TROQ12816 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TROQ12816 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TROQ12816 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TROQ12816 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TROQ12816 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TROQ12816 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TROQ12816 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TROQ12816 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TROQ12816 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TROQ12816 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TROQ12816 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TROQ12816 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TROQ12816 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TROQ12816 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TROQ12816 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TROQ12816 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TROQ12816 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TROQ12816 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TROQ12816 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TROQ12816 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TROQ12816 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TROQ12816 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TROQ12816 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TROQ12816 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TROQ12816 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TROQ12816 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TROQ12816 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TROQ12816 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TROQ12816 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TROQ12816 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TROQ12816 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROQ12816 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROQ12816 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROQ12816 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROQ12816 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROQ12816 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROQ12816 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROQ12816 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROQ12816 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROQ12816 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROQ12816 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROQ12816 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROQ12816 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TROQ12816 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TROQ12816 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TROQ12816 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROQ12816 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROQ12816 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROQ12816 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROQ12816 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROQ12816 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROQ12816 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROQ12816 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROQ12816 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROQ12816 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROQ12816 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TROQ12816 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TROQ12816 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TROQ12816 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TROQ12816 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TROQ12816 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms