Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNA1Q09470 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms