Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms