Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSBP1Q04837 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSBP1Q04837 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSBP1Q04837 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSBP1Q04837 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSBP1Q04837 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSBP1Q04837 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSBP1Q04837 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSBP1Q04837 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSBP1Q04837 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSBP1Q04837 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSBP1Q04837 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSBP1Q04837 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSBP1Q04837 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSBP1Q04837 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SSBP1Q04837 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms