Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
ATP7AQ04656 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7AQ04656 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms