Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms