Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms