Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms