Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms