Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCL20P78556 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCL20P78556 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CCL20P78556 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL20P78556 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL20P78556 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CCL20P78556 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL20P78556 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CCL20P78556 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL20P78556 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL20P78556 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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CCL20P78556 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL20P78556 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL20P78556 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CCL20P78556 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL20P78556 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CCL20P78556 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL20P78556 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL20P78556 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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